Abstrak Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pengembangan perangkat pembelajaran berbasis SQ3R dan web pada materi sistem pertahanan tubuh dan pengaruhnya terhadap peningkatan kemampuan berpikir kritis, motivasi belajar, dan hasil belajar peserta didik pada materi sistem pertahanan tubuh di kelas XI MAS Jeumala Amal Pidie Jaya. Pengambilan data dilakukan pada semester genap tahun pelajaran 2015-2016. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode quasi eksperimen dengan pendekatan bersifat kualitatif dan kuantitatif. Penelitian ini dilakukan pada 4 kelas yang terdiri dari 2 kelas laki-laki yaitu IPA 1 yang berjumlah 30 peserta didik sebagai kontrol dan IPA 3 yang berjumlah 30 peserta didik sebagai kelas eksperimen dan 2 kelas wanita yaitu IPA 4 yang berjumlah 30 peserta didik sebagai kontrol dan IPA 6 yang berjumlah 30 peserta didik sebagai eksperimen. Instrumen yang digunakan dalam penelitian ini yaitu soal berbentuk uraian untuk melihat kemampuan berpikir kritis, angket motivasi untuk melihat motivasi peserta didik, dan juga dan soal pilihan ganda untuk menilai hasil belajar peserta didik. Analisis data menggunakan uji Kruskal Wallis dengan bantuan SPSS 17.0 For Windows pada taraf signifikan 0,05. Hasil uji t menunjukkan bahwa P-value < batas kritis yaitu untuk kemampuan berpikir kritis 0,000